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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
28/07/2023 |
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Actualizado : |
28/07/2023 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
RODRÍGUEZ, J.D.; PERIPOLLI, E.; LONDOÑO-GIL, M.; ESPIGOLAN, R.; LÔBO, R. B.; LÓPEZ-CORREA, R.; AGUILAR, I.; BALDI, F. |
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Afiliación : |
JUAN DIEGO RODRÍGUEZ, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil.; ELISA PERIPOLLI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; MARISOL LONDOÑO-GIL, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil; RAFAEL ESPIGOLAN, Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Departamento de Medicina Veterinária, Universidade de São Paulo (Usp), Pirassununga, 13535-900, Brazil.; RAYSILDO BARBOSA LÔBO, Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores, Ribeirão Preto, Brazil; RODRIGO LÓPEZ-CORREA, Facultad de Veterinaria, Departamento de Genética y Mejoramiento Animal, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; FERNANDO BALDI, Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Jaboticabal, 14884-900, Brazil. |
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Título : |
Effect of minor allele frequency and density of single nucleotide polymorphism marker arrays on imputation performance and prediction ability using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction in a simulated beef cattle population. |
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Complemento del título : |
Research paper. |
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Fecha de publicación : |
2023 |
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Fuente / Imprenta : |
Animal Production Science. 2023, volume 63, issue 9, p. 844-852. https://doi.org/10.1071/AN21581 |
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ISSN : |
1836-0939; eISSN: 1836-5787. |
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DOI : |
10.1071/AN21581 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Submitted 1 December 2021, Accepted 1 March 2023, Published 4 April 2023. -- Correspondence to: Juan Diego Rodríguez,
Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Jaboticabal, 14884-900, Brazil. Email: juan.diego@unesp.br -- Handling Editor: Kim Bunter. -- |
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Contenido : |
Context: In beef cattle populations, there is little evidence regarding the minimum number of genetic markers needed to obtain reliable genomic prediction and imputed genotypes.
Aims: This study aimed to evaluate the impact of single nucleotide polymorphism (SNP) marker density and minor allele frequency (MAF), on genomic predictions and imputation performance for high and low heritability traits using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction methodology (ssGBLUP) in a simulated beef cattle population.
© 2023 The Author(s) (or their employer(s)). Published by CSIRO Publishing |
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Palabras claves : |
Bias; Bovine; Customised SNP arrays; Genomic selection; Imputation accuracy; Inflation; MAF; Simulation. |
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Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
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Marc : |
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500 $aArticle history: Submitted 1 December 2021, Accepted 1 March 2023, Published 4 April 2023. -- Correspondence to: Juan Diego Rodríguez, Universidade Estadual Paulista (Unesp), Faculdade de Ciências Agrarias e Veterinárias, Departamento de Zootecnia, Jaboticabal, 14884-900, Brazil. Email: juan.diego@unesp.br -- Handling Editor: Kim Bunter. --
520 $aContext: In beef cattle populations, there is little evidence regarding the minimum number of genetic markers needed to obtain reliable genomic prediction and imputed genotypes. Aims: This study aimed to evaluate the impact of single nucleotide polymorphism (SNP) marker density and minor allele frequency (MAF), on genomic predictions and imputation performance for high and low heritability traits using the single-step genomic Best Linear Unbiased Prediction methodology (ssGBLUP) in a simulated beef cattle population. © 2023 The Author(s) (or their employer(s)). Published by CSIRO Publishing
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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| Registros recuperados : 16 | |
| 2. |  | FERRARI, V.; IBÁÑEZ, F.; LADO, J.; ALVAREZ, A.; MARTINEZ, C.; MOLTINI, A.; GIMÉNEZ, G.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; RODRÍGUEZ, G.; VICENTE, E. Compuestos bioactivos y capacidad antioxidante en boniatos, frutillas y tomates del Programa de Mejoramiento Genético de INIA. [Resumen] In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Hortícola. Resúmenes. Jornada Mejoramiento Genético de Hortalizas: Ciencia y Tecnología para la producción y el consumidor, 2019, Salto, Uruguay. Trabajos de investigación relacionados al proyecto. Salto (UY): INIA, 2019. p. 14-15.| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 4. | | IBÁÑEZ, F.; FERRARI, V.; RODRÍGUEZ, G.; VICENTE, E.; MARTINEZ, C.; ALVAREZ, A. Cebollas del Programa de Mejoramiento Genético de Hortalizas de INIA como fuente de quercetina para una dieta saludable. [Resumen] In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Hortícola. Resúmenes. Jornada Mejoramiento Genético de Hortalizas: Ciencia y Tecnología para la producción y el consumidor, 2019, Salto, Uruguay. Trabajos de investigación relacionados al proyecto. Salto (UY): INIA, 2019. p. 12-13.| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 5. | | LEONI, C.; BRUZZONE, J.; VILLAMIL, J.J.; MARTINEZ, C.; MONTELONGO, M.J.; BENTANCUR, O.; CONDE, P. Percentage of anthracnose (Colletotrichum acutatum s.s.) acceptable in olives for the production of extra virgin olive oil. Crop Protection, June 2018, v.108: 47-43. Article history: Received 15 February 2017; Revised 27 September 2017; Accepted 8 February 2018; Available online 22 February 2018.
Partial results were presented at 8th International Olive Symposium, Split, Croatia, 10?14 October 2016.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 6. | | LEONI, C.; CONDE, P.; BRUZZONE, J.; MARTINEZ, C.; VILLAMIL, J.J.; BIANCHI, D.; ASHFIELD, R. Ante una nueva zafra olivícola, ¿cómo nos preparamos para manejar la aceituna jabonosa?. Revista INIA Uruguay, 2016, no.46, p. 34-37. (Revista INIA; 46)| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 7. | | CONDE, P.; VILLAMIL, J.J.; MARTINELLI, L.; BRUZZONE, J.; ASHFIELD, R.; BIANCHI, D.; MARTINEZ, C.; DAVILA, J.; ZOPPOLO, R.; VILLAMIL, J.M. Comportamiento agronómico de seis variedades de olivo en el sur y norte de Uruguay. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Frutícola. Resultados experimentales en olivo. Jornada de Divulgación. Canelones (Uruguay): INIA, 2015. p. 8-11 (Serie Actividades de Difusión ; 754).| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 13. | | VILLAMIL, J.J.; MARTINELLI, L.; BRUZZONE, J.; ASHFIELD, R.; BIANCHI, D.; MARTINEZ, C.; ZOPPOLO, R.; VILLAMIL, J.M.; CONDE, P. Variedades destacadas para el sur de Uruguay. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Frutícola. Resultados experimentales en olivo. Jornada de Divulgación. Canelones (Uruguay): INIA, 2015. p. 12-16 (Serie Actividades de Difusión ; 754).| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 14. | | MARTÍNEZ, C.P.; TORRES, E.A.; CHATEL, M.; MOSQUERA, G.; DUITAMA, J.; ISHITANI, M.; SELVARAJ, M.; DEDICOVA, B.; TOHME, J.; GRENIER, C.; LORIEUX, M.; CRUZ, M.; BERRÍO, L.; CORREDOR, E.; ZORRILLA DE SAN MARTÍN, G.; BRESEGHELLO, F.; PEIXOTO, O.; COLOMBARI FILHO, J.M.; CASTRO, A. PEREIRA DE; LOPES, S.I. GINDRI; BARBOSA, M.; FUNCK, G.R. DALTROZZO; BLANCO, P.H.; PÉREZ DE VIDA, F.; MOLINA, F.; ROSAS, J.E.; MARTÍNEZ, S.; BONNECARRERE, V.; CARRACELAS, G.; MARIN, A.; CORREA-VICTORIA, F.; CAMARGO, I.; BRUZZONE, C.B . Rice breeding in Latin America. Plant Breeding Reviews, 2014 v.38, p. 187-277., 2014| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó; INIA Treinta y Tres. |
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| 15. | | CONDE, P.; VILLAMIL, J.J.; FREDES, A.; BRUZZONE, J.; MARTINEZ, C.; MONTELONGO, M.J.; ELLIS, A.C.; GÁMBARO, A.; LEONI, C. Determinación del umbral máximo tolerable de fruta infectada por colletotrichum Spp. para la obtención de aceite de oliva extra virgen. In: INIA Las Brujas; Programa Nacional Producción Frutícola. Resultados experimentales en olivos. Canelones (UY): INIA, 2013. p. 31-37 (INIA Serie Actividades de Difusión; 721)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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